有学者认为这种差异是由生理因素造成，女性性染色体由两条X性染色体组成，因此对于女性而言，当一条X性染色体基因出现问题时，可以启动补偿机制进行基因修复，而对于只有一条X性染色体的男性而言则没有这种修复功能。

也有学者提出，男性比女性更容易患ASD，是因为他们大脑的心理生理属性上更容易显示极端男性化表现，而女性则需要更大的异常才能被诊断出来。